לדבריו של השר עמיחי שיקלי, ההחלטה התקבלה בלב כבד, לאחר שנחשף לרשימות המחבלים שצפויים להשתחרר בשלב הראשון של העסקה. "מדובר במאות רוצחים ועשרות מחבלים בכירים שהיו אחראים לאלפי פיגועים קטלניים, בהם קפה מומנט בירושלים, קניון השרון בנתניה, הטבח בקיבוץ מצר ועוד," כתב שיקלי.
השר הדגיש כי המסר העולה מהעסקה הוא שמאסר עולם בישראל אינו סופי, וכי חטיפת ישראלים הופכת לכלי מיקוח אפקטיבי. בנוסף, שיקלי הביע חשש שאחוזי החזרה הגבוהים לטרור – כ-80% לפי הנתונים שבידיו – עלולים לגבות חיי אדם נוספים בעתיד.
שיקלי ציין גם את הקושי במימוש שלב ב' של העסקה, שבו המחיר עלול להיות גבוה אף יותר. "הרף שהוצב בעסקה הנוכחית עלול להקשות משמעותית על המשך המשא ומתן," אמר.
למרות התנגדותו, הביע שיקלי הערכה למאמציהם של כל הגורמים שהיו מעורבים במשא ומתן. "אני מודה לכל מי שפעלו למען השבת החטופים ומקווה שחששותיי יתבדו," סיכם השר.
העסקה לשחרור החטופים, שאושרה ברוב קולות בממשלה, כוללת שחרור של מאות אסירים פלסטינים בתמורה להשבתם של החטופים הישראלים שנותרו בעזה מאז מתקפת ה-7 באוקטובר.